No está tan claro.

Elfos, duendes y hadas (y así les llamó Tolkien e los primeros escritos indistintamente) son elementos de la tradición que tomó para su mitología, y tienen tradicionalmente las orejas picudas (feericas). Si hubiera cambiado este hecho tan aceptado, lo más probable es que lo habría especificado, pero nunca lo hizo.
¿Que no se especifica tampoco a la hora de diferenciarlos de los hombre? No entiendo por qué os parece tan absurdo el argumento de que están tapadas con el pelo, pero es así. Cualquier persona que lleve melena suelta tiene las orejas cubiertas, y así es como llevan el pelo. A nadie se le ocurriría retirarle el pelo para mirarle las orejas a otra persona cuando la simple belleza y elegancia "élficas" suelen ser suficientes para distinguirlos. Es como si a un negro con barba y bigote que le tapara la boca pretendieses separársela porque no le puedes ver si sus labios son gruesos o no. Sería una intromisión exagerada, y además no hace falta.
Lo único claro es que no está claro si las tienen o no, pero yo creo que sí.