Es curioso, a mí siempre me dió la sensación de que Tolkien escribió el libro precisamente de manera que no se pudiera hablar de protagonismo absoluto, porque precisamente fue la colaboración de muchos la que completó la misión.
Fuera de eso, si se busca encontrar grados de protagonismo yo creo que individualmente es Frodo el que lleva el peso del argumento principal (hay que tener en cuenta que incluso cuando no está presente físicamente, las acciones de los demás están pensadas para propiciar el éxito de la parte que le ha tocado a él).
Si eligiéramos un protagonismo basándonos en quien aparece desde el primer momento hasta el final, entonces tendríamos que pensar en: los hobbits, es una posibilidad.

Besos