El tema de las orejas es bastante divertido. Como puedes ver en este artículo de wikipedia:
http://en.wikipedia.org/wiki/Hobbit#Appearance
en una carta de 1938 Tolkien describe a los Hobbits en éstos términos:
[quote]ears only slightly pointed and 'elvish'[/quote]
es decir, orejas ligeramente en punta y «élficas»
Ahora bien, como dijimos la carta es de 1938 por lo que al decir «élficas» Tolkien no se podía referir a «sus» elfos ya que nadie los conocía aún (nada sobre la Tierra media había sido publicado más allá de El Hobbit), sino a los elfos de la cultura popular, los «duendes», por lo que si bien esta frase nos dice claramente que los hobbits tenían orejas puntiagudas nada nos dice sobre las orejas de los elfos de la Tierra Media.
De hecho, como comentas no existe ninguna clara indicación sobre las orejas de los elfos.
Por mi parte (y esto es una opinión personal) estoy inclinado a pensar que las orejas de los elfos en nada se diferencian de las de los humanos. Me baso para decir esto en que siempre que un elfo «se da cuenta» que quien tiene en frente es un mortal lo hace al cruzar su mirada (pienso en el caso de Voronwë cuando encuentra a Tuor, pero hay otros): si las orejas élficas fueran diferentes de las orejas humanas, tendrían que ser notadas como marca distintiva antes que una sutil diferencia en la mirada...