Por si te sirve de algo

Con el Silmarillion, y la Historia de la Tierra Media, Christopher ha hecho precisamente lo que pides. Primero escribió el Silmarillion, basándose en un montón de textos diferentes de su padre e intentando darles una coherencia, y resumiendo o alargando ciertas partes de la historia; y a posteriori ha ido publicando en la Historia de la Tierra Media los textos de su padre en los que se basó.

Si lo que quieres saber es cómo decidir qué versión es la más correcta sobre una historia, qué versión sería la que hubiese publicado Tolkien, hay posiciones para todos los gustos. Están los que dicen que ninguna de ellas es la más correcta sinó que lo son todas, cada una en el momento en el que fue escrita. Otros dicen que contra más posterior es el texto, más fidedigno es, y que por lo tanto sólo deben aceptarse las ideas que cuadran con los textos tardíos de Tolkien. Muchos creen que el texto verdaderamente canónico es ESDLA (tal como fue publicado) y que por lo tanto las historias más fiables son aquellas que más se ajustan al cánon sentado en ESDLA.

Si quieres que te diga la verdad, yo todavía no estoy cien por cien segura de cual es mi criterio para decidir con qué versión me quedo, de momento creo que el criterio que más me gusta es el de la belleza: me quedo con la versión que me parece más bella, siempre que no cruja con el resto de la mitología.

Sobre la Historia del Señor de los Anillos no creo que tengas ningún problema. Son textos curiosos para conocer como fue la evolución del libro, pero ESDLA fue publicado en vida de Tolkien así que no hay dudas de cómo quería él que fuese la historia.

Ahora bien, si lo único que quieres hacer es una enciclopedia, tampoco tienes porque decantarte por una versión u otra, puedes optar por mencionarlas todas.

Saludos desde altamar