Pues sobre este tema hemos hablado ya varias veces... Y no es tan complicado como tal vez te parezca. El propio Tolkien dejó bastante claro que los Trolls eran simplemente, eso, trolls .

Cuando leemos El Señor de los Anillos, nos encontramos con que Bárbol afirma lo siguiente:

"- Ho, hm, bueno, podríamos hacerlo en verdad. No sabéis quizá qué fuertes somos. Quizás habéis oído hablar de los trolls. Son extremadamente fuertes. Pero los trolls son sólo una impostura, fabricados por el enemigo en la Gran Oscuridad, una falsa imitación de los ents, así como los orcos son imitación de los elfos. Somos más fuertes que los trolls. Estamos hechos de los huesos de la tierra."
(Las Dos Torres, “Bárbol”)

Y este texto nos hace a muchos entender que los Trolls fueron creados por Melkor, como, por ejemplo, le pasó a Peter Hastings (administrador de la Newman Bookshop, librería católica de Oxford), a quién el propio Tolkien aclaró esta duda en una de sus cartas:

"Bárbol no dice que el Señor Oscuro 'creara' a los Trolls y los Orcos. Dice que los 'hizo' imitando a ciertas criaturas ya existentes. Hay para mi un abismo entre ambas afirmaciones, tan ancho que la de Bárbol (en mi mundo) podría posiblemente ser verdad."
(J.R.R. Tolkien, Cartas, carta nº 153, pág. 224)

Como puedes observar, Tolkien hace una diferencia muy clara entre crear y hacer. Con crear, Tolkien alude a la creación de una vida partiendo de la nada, (lo que sabemos que sólo es capaz de hacer Eru Ilúvatar). Con “hacer” o “hechura” Tolkien se refiere, tal y como explica en la carta, a la corrupción de criaturas preexistentes modelándolas y alterándolas para que como “imitaciones” sirvan a sus oscuros propósitos. Esta idea se reafirma en una nota a pie de página de la misma carta:

“En esta historia mítica [...] la Creación, el acto de voluntad de Eru el Único que concede realidad a las concepciones, se diferencia de la Hechura, que está permitida. “
(J.R.R. Tolkien: Cartas, carta nº 153)

Además, en “El Anillo de Morgoth, Christopher Tolkien hace el siguiente comentario:

"En El Señor de los Anillos parece evidente que los trolls existían por derecho propio, pero que Melkor los 'estropeó' *.

* En el Apéndice F de El Señor de los Anillos (I) se dice de los Trolls:
En un principio, mucho tiempo atrás, en el crepúsculo de los Días Antiguos, éstas eran criaturas de naturaleza torpe y estúpida, y no tenían más lenguaje que las bestias. Pero Sauron las utilizó, enseñándoles lo poco que podían aprender y acrecentándoles la inteligencia con maldad"
(El Anillo de Morgoth, “La transformación de los mitos”, nota 3, págs. 468-469)

Por lo tanto, los trolls serían una especie preexistente, corrompida por Melkor.

Espero que esto te sirva para aclarar tus dudas.

Un saludo, desde La casita de Illuin