Bueno, es que Tolkien nunca llegó

a cerrar esos cambios, por eso no tienen respuesta muchas de las preguntas que haces al final.

Básicamente lo has entendido bien. Tolkien intentó modificar sus mitos de forma que cuadrasen con los conocimientos astronómicos. Por eso el Sol, debía existir antes que la Tierra (y la Tierra es donde están las Lámparas y los Árboles, por eso Anar debía existir antes que las Lámparas y los Árboles).

Esto entonces pone otro problema. Si el Sol ya existía, ¿por qué iban los Valar a crear las Lámparas y luego los Árboles si la Tierra ya tenía luz?. Una opción hubiese sido eliminar las Lámparas y los Árboles de los mitos. Pero esa opción no le gustaba, así que para explicar la existencia de las Lámparas y los Árboles, la luz del Sol ha de ser ocultada de la Tierra. Y ¿quien mejor para ocultarla que Morgoth?

Por otra parte, los Árboles siempre han sido en el símbolo de la luz pura, de la luz antes de la corrupción. De ahí la importancia de los Silmarills, que contienen la luz pura de los Árboles antes de que Morgoth y Ungoliant los corrompiesen, y del porqué Fëanor los entregará para que sean abiertos después de la Batalla Final.
Tolkien no quería que de ninguna manera los Árboles tuviesen luz corrupta, y de ahí lo de que los Árboles nazcan de la luz del Sol antes de ser corrompida por Morgoth.

Pero como has visto, todo esto dejaba demasiadas cosas en el aire y obligaba a cambiar demasiadas cosas de los mitos existentes.Y Tolkien al final no quiso o fue incapaz de cambiar todo eso, por lo que estas modificaciones de los mitos que corresponden al Mundo Redondo se quedaron a medias, con todas esas preguntas que haces, sin contestar.

La verdad, es que prefiero la poesía de los Árboles a todos esos cambios del Mundo Redondo

Saludos desde altamar