Bueno, sin ser experta en el tema, te puedo decir que, a mi modo de ver, Merry es más serio, más responsable y más maduro que Pippin. De hecho, Pippin se apoya constantemente en él, es como un hermano mayor, además de ser su mejor amigo. Pippin es más infantil y más atolondrado, aunque su personaje cambia mucho a lo largo de la historia. Similitudes .... bueno, claro que tienen muchas. Solo el hecho de ser hobbits les hace tener unas características de personalidad muy parecidas, cosa que, en principio también comparten con Frodo y con Sam, aunque luego la historia les haga cambiar a todos y cada uno de ellos y les haga evolucionar de un modo distinto.
Merry y Pippin son, por todo lo que les ocurre hasta el final de la historia (y que, por supuesto,no te vamos a contar), por la forma en que, consciente o inconscientemente, contribuyen en el desarrollo de ésta, y por la evolución que sufren sus personajes, mis favoritos.